直肠阴道瘘分为先天性和后天性。先天性主要是由先天因素引起的，后天性直肠阴道瘘，病因复杂，常见于分娩创伤，妇科盆腔手术，直肠吻合口漏后直肠癌，晚期癌症，感染，放射损伤，性暴力等人为创伤。

直肠阴道瘘是直肠和阴道上皮表面之间的先天性或后天性通道。如果粪便不大且粪便稀薄，可以按时排便。如果孔较大且无法控制大便，将引起极大的疼痛，应进行手术治疗，那么直肠阴道瘘是怎么得的？
　　直肠阴道瘘的临床表现范围从轻度排便到大量排便。当瘘管较小或肛门狭窄，其特征为慢性肠梗阻不完全。在出生后几天甚至几个月或2至3年后，儿童排便困难，顽固的便秘有时需要灌肠或泻药排便。如果没有阻塞，但肠位异常，肠蠕动疼痛和粪便变形。
　　肛肠周围形成脓肿后，如果治疗不及时或不当，脓肿可渗入直肠阴道中隔，形成直肠阴道瘘；当局部药物浓度过高，剂量过大等情况，会引起局部组织感染，坏死形成；妇科肿瘤手术，如肿瘤与直肠粘膜粘连或侵犯直肠，脱皮会损伤直肠，形成直肠阴道瘘；常见于产科分娩过程中，如会阴部保护不当或切断阴位偏差，后纵正中线也会导致直肠阴道瘘的形成；直肠阴道瘘的原因大致分为以下几类。
　　先天性畸形和外伤，直肠阴道瘘的先天性和外伤性原因较少见。
　　医源性
　　医源性引起的直肠和阴道病例中更常见。由于阴道和直肠之间的紧密关系，生理结构仅具有一层阴道直肠，其厚度不超过5mm。因此，涉及直肠和阴道的手术和术后炎症可能会相互干扰，导致医源性直肠阴道瘘。临床上常见的是先天性损伤和腹部直肠癌根治术。
　　肿瘤因素
　　与医源性因素相比，肿瘤相关的因素比起医源性因素更易导致直肠阴道瘘，这是女性生殖系统衍生的肿瘤，例如子宫，阴道肿瘤或直肠周围的浸润性组织导致直肠阴道瘘，而这些肿瘤是常见的。放射治疗引起的炎症会导致直肠阴道瘘。